目前大医院药品收入占医院整体收入的比例大概在40%左右，实行0差率后，医院总收入将减少6%左右；同时，医院毛利率总体水平一般保持在40%～45%左右，毛利部分正是医院能够自主分配的部分。而减少药品带来的6%的收入，即意味着医院毛利率直接下降6%，对医院的日常运行必将产生较大的影响。

　　国内医药分开试点较受关注的莫过于深圳全市取消药品加成0差率销售。

　　北京的做法是通过设立医事服务费和医保兜底来进行补偿。医事服务费从42～100元分4档，收入的60%用于增加医务人员收入。以急诊门诊人次为基础进行测算，2010年和2011年的分别为1.46亿和1.6亿次，总药品费用大概为300亿元左右，即加成部分在45亿～50亿元之间。如果这一补偿方式在北京铺开，以静态匡算，北京市医保需要多支出13亿元左右。医保增加13亿元加上医事服务收费，基本上能够达到平衡。

　　深圳市则采取分级提高门诊和住院诊查费的价格标准，在原来基础上平均每门诊人次和每住院床日诊查费分别提高14元和37元。同时进行门诊控费，全科门诊打包付费，专科门诊“控高就0”，住院321种病种实行临床路径。

　　经测算时发现，此项政策实施后，深圳每年可减轻参保人自付费用2.09亿元，增加部分由社会医疗保险统筹基金承担。